蛋白质二级结构包括哪些类型
蛋白质二级结构是指多肽链主链原子的局部空间排布,不包括侧链的构象。它主要有α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲四种。两条以上肽链或一条肽链内的若干肽段平行排列,通过链间羰基氧和亚氨基氢形成氢键,维持β-折叠构象的稳定。
1、α-右手螺旋类型:
α-螺旋为右手螺旋,每一圈含有3.6个aa残基(或肽平面),每一圈高5.4Å。即每一个aa残基上升1.5Å,旋转了100度,直径为5Å,2个二面角(ф,ψ)=(-570,-480)。
2、β-折叠类型:
肽链在空间的走向为锯齿折叠状,二面角(ф,ψ)=(-119℃,+113℃)。维持β-折叠的力量是折叠间的氢键;它产生于一个肽平面的C=O,与相邻肽链的在空间上邻近的另一个肽平面的N-H之间;两条肽链上的肽平面互相平行,有平行式和反平行式两种。
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